如今在人类组织中呼风唤雨的瑞恩，在四年前还是一个地方网络电台的小主持。他的投资多次失利，声名也每况愈下。就在这时，瑞瓦来到他身边，与瑞恩谈合作。

瑞恩本想着不愿跟变种人合作，但他是个生意人，面对名利双收的诱惑，瑞恩只意思意思地考虑了一下，便答应了瑞瓦。洛娜查到了麦克斯的行踪后通知马可斯，马可斯便来到麦克斯经常惠顾的便利店，待他出来时，偷袭麦克斯。马可斯原来只是想威胁他，没想到麦克斯却反杀了一下。马可斯情急之下，只得使出异能，在车内混战时，麦克斯命丧马可斯手下，马可斯也受了伤。麦克斯彻夜未归，引起瑞瓦等人的怀疑。

洛娜强作镇定，不能在瑞瓦面前暴露一点儿不自然的地方。福斯特三姐妹在瑞瓦的指示下，开始进行内部调查。麦克斯的失踪，不禁让他们怀疑，核心圈中出现了内鬼。瑞瓦给了瑞恩一个新的任务，清理住在地下的莫洛克人。

瑞恩知道莫洛克人一直处于中立地位，他也不便出手，瑞瓦看着瑞恩这个怂样，便给了他一个提议，可以让他的新傀儡“特纳”替他干这个脏活。单纯的特纳很快便听了瑞恩的话，和“肃清者”团队的人一起闯入了莫洛克人的地盘。

然而，尔格他们也不是吃素的主，在特纳等人刚闯入时，便开始准备着迎战。但有战火，就必定有伤亡，克拉丽丝加入莫洛克人后，原以为能安安稳稳地过日子，但自己不找别人麻烦，麻烦倒总是找上门来。她知道特纳一伙人的武力十分强大，不得已之下，只好求助约翰他们。约翰和马可斯收到通知后，立即前往救援。

特纳和尔格双方也开始了激烈的交火。克拉丽丝不想强行对抗，她知道，躲在地下的莫洛克人有很多都是像她这样希望过着与世无争日子的变种人，他们的对抗能力都不高，还大多都是老弱妇孺。约翰等人很快便前来接驾，克拉丽丝利用自己的异能，把同伴们运走。特纳等人以肉身之躯迎击，很快便有人牺牲了。

双方都杀红了眼，对抗越演越烈，幸好克拉丽丝在约翰的帮助下，越来越多的莫洛克人得以逃脱。特纳等人很快破门而入，直捣莫洛克人的大本营。尔格等人死守最后一道防线，待克拉丽丝运送着最后一批同伴后，尔格才离开。约翰原以为大功告成，迎接克拉丽丝，没想到，特纳突然从后狙击，克拉丽丝背对着特纳，面对着约翰，就这样中弹倒地。克拉丽丝打开的空间随即消失，只在约翰面前留下几滴克拉丽丝的血。

福斯特三姐妹查出了问题所在，是监控出了问题。核心圈的监控一直由莎吉操控，莎吉自称这系统有99%以上的防御力，如今出了问题，莎吉自然责无旁贷。找出问题所在后，瑞瓦和福斯特立即审问了莎吉，但莎吉除了否认，却没有任何证据证明监控不是被自己篡改的，瑞瓦再福斯特三姐妹面前，把莎吉就地正法。

安迪知道消息后，便找到洛娜，把这事告诉了她。

洛娜知道真相，却不能在安迪面前表现一二，她害死了莎吉，愧疚得有点不知所措。

安迪和洛娜一起，敲开了马可斯他们暂住的家门。洛娜和马可斯冰释前嫌，安迪也和家人团聚。现在正是合家欢聚的时刻，可惜社会形势没有时间让他们好好依偎寒暄。

瑞瓦的野心越来越大，当务之急，是要铲除核心圈的势力，不让瑞瓦和瑞恩再胡作非为。大伙儿商量着，怎样最好地抵抗瑞瓦。

洛娜等人都认为，既然安迪和劳伦再度合体，靠他们便可以施展芬利斯双子的异能，摧毁瑞瓦的大楼。但凯特琳本着保护小孩的心情，希望能不让儿女出手便不让儿女出手。劳伦听后，便安抚了母亲的情绪，她认为既然有自己和安迪在，就应该发挥他们的作用。

而且他们之前作了这么多准备，感觉就是为了这一刻。就在大伙儿达成共识，制定了摧毁核心圈大楼的计划后，约翰突然感觉到异样。原来，瑞瓦发现洛娜和安迪的叛变后，她便联系了瑞恩，让瑞恩赶紧派出他的肃清者手下，为地下组织的人制造一场惊喜。约翰感受到一大堆卡车和重装士兵距离他们越来越近。原来是肃清者追踪到他们的行踪，未等约翰他们反应过来，肃清者便包围了他们居住的大楼。

这下子，他们的计划也被打乱了。面对肃清者的闯入，他们也只能选择硬碰硬的的形式。凯特琳之前买了一批枪支藏了在地下室，里德和凯特琳一起去取枪抵抗。房间里只剩下劳伦和安迪。突然间，劳伦看见房门有点不对劲，刚才妈妈出去时明明把门关了，但这时，门却是开的。话音刚落，福斯特三姐妹和“隐藏”便现了身。

原来这是瑞瓦声东击西的方法，他们故意让肃清者制造骚动，把地下组织的变种人的注意力都集中在肃清者那边，从而让劳伦和安迪放松警惕，好让福斯特三姐妹乘虚而入。

福斯特三姐妹入侵了姐弟两人的心智，控制他们摧毁了一栋人类大楼。哪怕劳伦和安迪意志一直在抵抗，但这只会让他们增加内伤。里德他们发现劳伦失踪后十分焦急，在约翰的探知能力下，找出了安迪他们的行踪。

这下子，瑞瓦的计谋也呼之欲出。一旦劳伦和安迪两人被带到瑞瓦那里，遭瑞瓦利用，这一定会为世界带来十分惨重的伤亡。为了给里德他们争取拯救劳伦和安迪的时间，约翰身先士卒，主动走出道路，引开特纳的注意。里德他们趁机驾车逃走，随后便往安迪他们那里赶去。他们找到福斯特三姐妹后，双方对峙起来。

洛娜看见三姐妹中的埃斯梅，知道她不是坏人，于是动之以情晓之以理，总算让埃斯梅动摇了，放开了自己的异能，让马可斯他们能击晕另外两个福斯特姐妹。安迪和劳伦被带到安全区暂时休息，但是他们已经没有动力再去执行摧毁核心圈的精力了。于是洛娜，马可斯连同里德夫妇一起来到瑞瓦所在的大楼中。

在大楼的停车场，他们遇见了正在准备出外勤的两个变种人和“隐藏”，并开始了一场大战。在对战中，主力洛娜和马可斯都被对手拖住无法脱身，里德心知不能再拖延下去了，孤身一人上楼对抗瑞瓦。

在瑞瓦的声波攻击中，里德最终释放了自己的所有能量，成功瓦碎了瑞瓦。