洛娜因为在狱中过于特立独行，且老是动坏脑筋想逃跑，不断被哨兵特勤处转移监房。这次的监房转移让她遇到了一位老熟人——害她被抓的里德。里德想跟洛娜好好谈一谈，因为这时的他已经不像以前那样讨厌变种人，但洛娜完全不买他的帐，反而听见他说连累了马可斯后，对他更加厌恶了。

另一边厢，变种人地下组织正激烈地讨论该不该冒险救洛娜。有部分变种人认为这个行动太危险了，很可能不仅救不出洛娜，还把自己的命也搭进去。马可斯受不了自私的大家，于是把话摊开来说，告诉在座的人都欠洛娜一份人情，大家都或多或少接受过洛娜的帮助。

约翰和他的女朋友索尼娅自然义不容辞地帮忙，而凯特琳知道里德和洛娜现在同坐一条船，于是也同意这次的营救计划。

大部分变种人达成共识后，便开始商量营救的方式。虽然他们可以借助克拉丽丝空间瞬移的能力，但现在特勤局盯得十分严，要找到囚车把洛娜和里德移走，就必须知道他们的行进路线。为了得知准确的消息，马可斯不得不找回以前的损友——一个洗黑钱兼贩毒集团。马可斯回到一个肮脏混乱的夜场，想向老熟人求助。

此时犯罪集团原来的老大已经退位，目前的负责人士马可斯的前女友卡门，以前老大的女儿。原本卡门对马可斯当年抛弃自己还有点怀恨在心，但想到马可斯的能力，便答应了这个交易。

获知囚车的出现地点后，大伙儿还面临一个难题，就是要如何把囚车停下来，好让他们得手。劳拉知道后，立即告诉弟弟安迪，让他施展能力担起这个重任。里德在狱中，向洛娜坦白了一切，并为之前自己的所作所为作出惭愧。

虽然里德之前犯下的过错无法挽回，但洛娜也明白里德之前也只是职责所在，于是默默地接受了与他结盟的事。

与此同时，克拉丽丝脑海里不断浮现和约翰之间的回忆，她不知道这其实都是索尼娅的回忆，只是为了让她因为在意约翰而更好地施展能力。

约翰想着四年前的往事，独自陷入了沉思。曾经事美国军人的他，冒着生命危险，为国前往伊拉克驻兵，然而回国后，不仅没有得到应有的重视，还因为他那变种人的身份，而遭到路人的谩骂。

就在他向同伴诉苦时，突然间发生了一场爆炸，是变种人大战就此展开。变故之后，变种人从此沦为被追捕的对象，约翰连仅有的尊严——自由都失去了。

克拉丽丝知道索尼娅改了自己的记忆后，心里一直耿耿于怀，她质问约翰到底心里是怎么想的，约翰回答得十分模棱两可。

克拉丽丝本来心里对约翰就有好感，她问约翰，之前救自己的时候，是利用她的能力，把她当作万能开锁器，还是真心有为她着想。约翰的回答再一次让克拉丽丝伤透了心，约翰对克拉丽丝充满愧疚，却没有一丝情意。克拉丽丝一怒之下，离开了变种人地下基地。脉冲的叛变让变种人组织十分在意，特勤局有能力让他们产生内讧，这当中一定有什么秘密。里德在脉冲的手臂上纹了一个图案，他认出了这个图案在巴顿鲁日的联邦大楼中看见过。为了查明真相，他决定联手和马可斯一起去一趟巴顿鲁日，找出特勤局让变种人内讧的秘密。

里德的儿子安德鲁表示想跟着一起去，他的能力可以助马可斯和爸爸一臂之力。三人结伴，坐上了一辆伪装成运输农产品的卡车，向巴顿鲁日出发。

路上虽然遇到特勤局的临时检查，但三人合力，最后还是顺利到达了联邦大楼。他们成功潜入变种人对策负责人的办公室，把变种人的档案资料都拿到了手。然而，事情并未就此结束，特纳锲而不舍地追踪他们，根据蛛丝马迹，追到了巴顿鲁日。三人带着资料连忙逃跑，但在路上，特勤局火力全开，三人陷入了险境。

就在千钧一发之际，劳拉突然施展了控制空气的超能力，帮马可斯三人的卡车挡走了全部攻击。里德和儿子安然无恙地回到了凯特琳身边，马可斯也回到了洛娜身边，美美地睡了一觉。

然而，真正的战争现在才开始。特勤局让变种人叛变的真相尚未查清，克拉丽丝离开变种人组织后，去向不明。马可斯在结束了一连串的逃忙和战斗后，想着能平静一番，却接到了前女友、贩毒集团首领卡门的电话。

卡门要求马可斯要还之前欠她的人情，她帮马可斯救了磁铁女，马可斯现在要替她办事，不然的话，卡门便把变种人组织的信息告诉特勤局。