三年前，约翰被人发现了变种人身份后，便失去了海军陆战队的军人身份，只能靠着在黑市打拳为生。拳赛一场接一场，约翰在赛事的间隙歇息时，一位优雅的女士找上了他。这是一位律师，也是一位变种人，叫伊凡洁琳。

自此之后，约翰便受到伊凡洁琳的帮助，加入了变种人地下组织。瑞瓦侵占了一处军事建筑，给洛娜用于生孩子。洛娜生产过后，福斯特三姐妹给了负责人一笔钱，当作掩口费。但瑞瓦并不是这个意思，一向心狠手辣的她，要求福斯特三姐妹“处理干净”。三姐妹中，在变种人地下组织待过一段时间的埃斯梅，渐渐地对瑞瓦的残忍指令都留了手，她的不妥引起了另外两名姐妹的怀疑。

约翰和马可斯再次断掉了核心圈的线索，经过一番查探，他们发现核心圈正在进行很多笔大额资金的转移。为了接近核心圈，约翰想起了一位可靠的旧友——伊凡洁琳。伊凡洁琳对于约翰来说，不仅有知遇之恩，还有复杂的情感。

在约翰深受药物困扰时，是她帮助约翰度过难关。他带着马可斯等人拜访了伊凡洁琳，让她感到既惊又怕。今时不同往日，如今变种人的地位比以往更难立足了，伊凡洁琳好不容易没被军队的人盯上，面对约翰的求助，她显得有点犹豫。

安迪最近做梦，在梦里能遇见劳拉，并看见自己主动拉着劳拉的手，希望她加入自己。但劳拉的样子，好像十分惧怕自己，甚至为了挣脱自己的手，不惜跳楼。安迪从梦中醒来，心思絮乱。

第二天训练时，他的状态十分不佳，这让瑞瓦十分在意。安迪随意编了个理由搪塞过去，但瑞瓦岂是等闲之辈，她安排了一名会隐身的部下“隐藏”跟踪安迪，看他葫芦里卖什么药。果然，安迪想念劳拉和家人了，他打电话到凯特琳的诊所，想跟劳拉聊聊，但接电话的是父亲里德。安迪在电话另一头不敢作声，最后毅然把电话挂掉后，毁掉了手机。

但此举动被“隐藏”看了在眼里，安迪的举动立即被上报至瑞瓦那里。瑞瓦再次看见安迪训练失利，认为他心里对自己的忠诚度不够纯粹，立即对他动起了杀心。瑞瓦以一脸知心姐姐的姿态，来到安迪房间，想跟他聊聊，看他是否对自己坦白。

安迪知道自己最近的表现让瑞瓦十分不满意，但他万万没想到，自己只是想家了，会引来瑞瓦的杀心。在瑞瓦转身，准备对安迪施展异能时，安迪不知怎地，想袒露自己想念家人的事，于是便把他打电话给劳拉的举动，告诉了瑞瓦。

瑞瓦听后，念在安迪还是肯对自己坦白，于是收了手，恢复了知心姐姐的模样。伊凡洁琳自己不便出手帮助约翰，但她向约翰提供一个名字——尔格。

这是一个住在华府地下隧道的独立变种人，他手上有很多隐秘的情报，希望能帮到约翰。

马可斯去过核心圈后，发觉洛娜和安迪已经对瑞瓦归心了，而且瑞瓦最近的资金、技术动向，让地下组织的大伙儿很在意。

他们不想坐以待毙，决定先发制人，先想办法找个突破口，阻止瑞瓦一行人的活动。

他们得知安迪等人正在吸纳资金、招揽变种人加入他们的组织，于是得想办法找到他们的定位。马可斯、约翰和克拉丽丝先结伴出发，去找黑客变种人“连线”帮忙。就在出发时，里德突然叫住了约翰，把自己最近异能显现的事告诉了他，希望他给点建议。

里德希望通过药物或情绪，控制住自己的异能，但约翰却觉得这不可能。想要抑制异能的最佳方法，就是学会怎么控制它。马可斯等人来到“连线”的工作室，却遭到一阵枪火的“欢迎”礼。原来“连线”因为帮助马可斯他们，被瑞瓦灭口了，现在工作室只剩下他的弟弟图表。图表一看见这群间接害死自己哥哥的人，便用枪火来招呼他们。

但他们要突破瑞瓦的行动，黑客技术是必要的，他们只好与图表打起来，随后把他制服，带回地下组织。图表醒来后，不愿帮助他们，凯特琳一心想要回自己的儿子，于是想了个极其不道德的方法，就是用紧急戒断毒瘾的药物，注射到图表体内，让他瞬间感受戒毒的痛苦，逼他帮黑入安迪所在位置的摄像头。

图表苦不堪言，只好乖乖就范，调取了摄像头的位置，发现瑞瓦她们正在一个监禁变种人的中心。洛娜以前也在那里被关押过一段时间。马可斯、克拉丽丝、约翰立即来到安迪、洛娜所在的研究中心，劳伦也加入。

劳伦不希望弟弟和同伴们兵戎相见，她也知道，只有自己才能劝说得了弟弟。约翰和克拉丽丝先转移进入中心里面，马可斯和劳伦则在外围接应。两人进入后，看见到处一片狼藉，很多变种人都受到非人的对待。他们一边慨叹着，一边通过凯特琳在指挥中心看着图标调取出来的监控，追踪着洛娜他们的踪迹。

突然，图表发现自己的黑客代码被挡住了，瑞瓦那边应该发现了端倪，有人抵抗了图表的入侵。与此同时，约翰和克拉丽丝也遇到了洛娜。

他们大声叫唤着洛娜，洛娜却以冷若冰霜的脸庞，施展了异能后，便转头离开。洛娜的异能，解开了约翰他们面前的一片门锁，一群被囚禁的变种人瞬间释放。被囚禁多日的变种人就如猛兽般，自相残杀，随意施展异能。约翰他们的去路被挡住了，此时还有不少性格和善的变种人在混乱中受了伤，约翰他们不能坐视不理，只好选择先救人。

他们把洛娜和安迪带走了一名变种人的事告诉了在外接应的劳伦和马可斯，让他们尽快出手阻止。而另一边厢，图表打算放弃时，凯特琳继续故技重施，对着忍受戒瘾折磨的图标，亮出一瓶兴奋药品，以此作条件让他再好好想办法。

瘾君子图表受不住这样的诱惑，施展了浑身解数，再次调取了监控录像。

凯特琳在摄像头中，看见了安迪，她高兴坏了，儿子安然无恙，但里德在一旁看着凯特琳疯狂的行为，感到十分不妥，而且安迪他笑着干这些事，他是乐意的，是自愿的。